ÁREA DE CONCENTRAÇÃO: BIOINFORMÁTICA
DISCIPLINAS OBRIGATÓRIAS
Créditos: 03 Carga Horária: 45h
Ementa: Noções básicas sobre Sistemas Operacionais baseados em Unix. Uso da Internet como ferramenta de pesquisa e análise para biólogos. Bancos de dados biológicos. Bioinformática na pesquisa Genômica estrutural e funcional. Programas e algoritmos para alinhamentos de seqüências de DNA e proteínas, busca por similaridade de seqüências, seqüências reguladoras, motivos estruturais em seqüências de proteínas e análise filogenética.
Créditos: 04 Carga Horária: 60
Ementa: Problematização em Bioinformática. Geração de atitude reflexiva que possa ser convertida em produto intelectual de qualidade, valorizando sua inserção acadêmica bem com sua relevância social. Reuniões e discussões multidisciplinares com os grupos envolvidos possibilitando a interação, troca e soma de conhecimento de todos os projetos de pesquisa do curso proposto.
Créditos: 04 Carga Horária: 60
Ementa: Esta disciplina abrange assuntos multidisciplinares que serão apresentados regularmente com a finalidade de divulgar e incentivar as pesquisas realizadas.
Créditos: 04 Carga Horária: 60
Ementa: Apresentação dos conceitos básicos e convencionais dos princípios que regem o método científico e as bases éticas de sua sustentação. Discussão das fases do projeto de pesquisa desde o planejamento inicial da proposta até a divulgação dos resultados. Orientação sobre o acesso às fontes de informação, visando o manuseio de periódicos e o levantamento bibliográfico do conteúdo científico correlato. Discussão de estratégias de organização das referências bibliográficas a serem utilizadas como base de apoio à elaboração e desenvolvimento do projeto.
DISCIPLINAS OPTATIVAS
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Algoritmos em bioinformática. Técnicas para solução de problemas. Análise e adaptação de softwares livres para bioinformática. Aplicação de conceitos existentes e desenvolvimento de novos relacionados a problemática da área. Foco maior em profundidade.
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Introdução a conformação de proteínas, cristalogêneses, preparação e cuidados com proteínas para cristalização, métodos de cristalização, montagem de cristais de proteína para coleta de dados, geradores de raios X, detetores de área, dados preliminares e simetria cristalográfica, processamento de dados, métodos de determinação de estrutura, substituição isomorfa múltipla, substituição molecular, dispersão anômala, promediação da densidade eletrônica e nivelamento do solvente, Métodos de refinamento do modelo cristalográfico, análise cristalográfica, análise de modelos estruturais, prática de cristalografia em computador.
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Armazenamento e recuperação de Dados: Conceitos básicos. Organização de Arquivos: Definição e conceitos; Estruturas; Organização; Métodos de acesso. Modelos de Banco de Dados. Caracterização de banco de dados local e remoto. Linguagem SQL: definição, conceitos, comandos básicos e avançados. Conceitos sobre Sistemas Gerenciadores de Banco de Dados. Técnicas de interfaceamento entre aplicação e SGDB (camada de acesso). Projeto, construção e administração de SBGD. Princípios de gerência de bancos de dados distribuídos: introdução, requisitos funcionais de SGBD distribuído, especificação de interfaces, controle de concorrência a dados, controle de integridade. Tecnologias aplicadas a Banco de Dados.
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Conceitos de bioestatística. Medidas de tendência central. Medidas de dispersão. Probabilidade. Testes de comparação de médias. Comparação de proporções. Tabela de contingência. Teste Qui quadrado. Teste de aderência. Análise de acurácia e concordância. Risco relativo. Correlação. Regressão linear. Regressão não linear. Análise da variância. Teste de Tukey para comparação de médias. Erros. Controle estatístico de qualidade. Análise de sobrevivência. Análise de grupos. Análise Multivariada.
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Armazenamento e recuperação de Dados: Conceitos básicos. Organização de Arquivos: Definição e conceitos; Estruturas; Organização; Métodos de acesso. Modelos de Banco de Dados. Caracterização de banco de dados local e remoto. Linguagem SQL: definição, conceitos, comandos básicos e avançados. Conceitos sobre Sistemas Gerenciadores de Banco de Dados. Técnicas de interfaceamento entre aplicação e SGDB (camada de acesso). Projeto, construção e administração de SBGD. Princípios de gerência de bancos de dados distribuídos: introdução, requisitos funcionais de SGBD distribuído, especificação de interfaces, controle de concorrência a dados, controle de integridade. Tecnologias aplicadas a Banco de Dados.
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Usabilidade: conceito de usabilidade e ergonomia, definições básicas, histórico, interface homem-computador. Visões da Usabilidade: Nielsen, ISO/IEC 9126, ISO 9241, elementos comparativos entre as normas. Engenharia da usabilidade: definição, conceitos, psicologia cognitiva, sociologia, ergonomia, semiótica, engenharia de software. Sistemas interativos: definição, evolução, componentes básicos(interface com o usuário, aplicação, base de dados). Interfaces Homem-Máquina: definição, evolução, conceitos, preocupações fundamentais na construção da interface (janelas, botões, cores, tipos e tamanho das fontes, posições dos objetos na janela, ligação entre janelas, quantidade de elementos por janela, navegabilidade). Métodos e critérios de avaliação da qualidade das interfaces. Estilos de Interação. Modelagem estrutural: classes; relacionamentos; diagramas; diagramas de classes; interfaces, tipos e funções; pacotes; instâncias e diagramas de objetos. Diagramas comportamentais: interações; diagramas de casos de uso; diagramas de interação; diagramas de atividades; máquinas de estados; diagramas de gráficos de estados. Modelagem da arquitetura: colaborações; diagramas de componentes; diagramas de implantação.
Créditos: 01 Carga Horária: 15h
Ementa: Conceituação e discussão das propriedades e estruturas das biomoléculas que constituem os organismos vivos e suas funções na bioquímica celular.
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Apresentar tecnicas de inteligência aplicada para aplicação na resolução de proplemas da Bioinformática complexa. Redes Neurais (conexionistas), Lógica e Conjuntos Difusos, reconhecimento de padrões, sistemas especialistas, algoritmos genéticos. Aplicação para resolução de problemas.
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Conceitos de procedimentos e Algoritmo. Técnicas para solução de problemas. Estilos de programação. Técnicas para refinamento e depuração de procedimentos. Estruturas de controle e recursividade. Tipos abstratos de dados: listas, pilhas, filas. Representação e manipulação de dados: tabelas, listas, árvores, grafos. Arquivos. Técnicas para ordenação e pesquisa. Utilização de linguagem de programação. Conceituação de abstração de dados. Caracterização, análise e implementação das estruturas básicas: listas lineares, pilhas, filas e árvores. Caracterização, análise e implementação de métodos de pesquisa em tabelas, de pesquisa seqüencial, de pesquisa binária e de pesquisa por cálculo de endereço. Caracterização, análise e implementação de métodos de ordenação de dados. Conceituação e caracterização das organizações básicas de arquivos.
Créditos: 04 Carga Horária: 60h
Ementa: Estrutura de genes e cromossomas. Replicação e transcrição. Biossíntese de proteínas e sua regulação. Reparo do DNA. Mutações. Recombinação gênica.
Créditos: 02 Carga Horária: 30h
Ementa: Regulação da expressão e controle da síntese de proteínas em procariotos e eucariotos. Operon Lac, Operon Trp. Sistemas ntr e nif.
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