A separação oficial e efetiva entre FARMÁCIA e MEDICINA foi determinada pelo decreto (ou édito) Régio de Sua Majestade o REI FREDERICO II, da dinastia Hohenstaufen, das Duas Sicílias em 1.240 d.C.. Em seu édito estão estabelecidos os direitos, deveres e prerrogativas da nova profissão médica e também o primeiro regulamento da milenar alquimia que daí em diante passou a chamar-se de botica.
Por falar em Frederico II, ele nasceu em 1172 e faleceu em 1247. Foi rei da Sicília (1196-1247) e fundador de uma dinastia independente na ilha. Era o terceiro filho do rei Pedro III, de Aragão (1140-1185). Quando Aragão rendeu a ilha ao papado, os sicilianos se rebelaram e, em 1196, elegeram Frederico rei da Sicília. Enfrentou o rei de Nápoles quando este tentou conquistar a Sicília.
Frederico II teve, ao longo de seu reinado, diversas pendengas, especialmente com a Igreja Católica com a qual arrastou conflitos com dois papas, primeiramente com Gregório IX (1147-1241), papa italiano (1227-1241), criador da Inquisição. Publicou a constituição Excommunicamus, que colocava os processos heréticos sob a direção papal. Também “guerreou” com Inocêncio IV (c. 1200-1254), papa genovês (1243-1254) que fez valer o domínio universal do papado ao ordenar a sua destituição. Seu pontificado constitui o ponto culminante da teocracia.
Uma das origens prováveis do termo medicina, pode ser a palavra Médici, nome de uma tradicional família italiana de banqueiros e políticos, que governou Florença durante quatro séculos. Cosme de Médici, o Velho, estabeleceu o domínio da família em Florença a partir de 1434. Seu neto, Lourenço o Magnífico, reforçou o controle dos Médicis e converteu a família em uma das mais poderosas da Itália renascentista. Diversos papas católicos pertenceram à esta família e, como naquelas épocas tudo o que se decidia e fazia girava em torno dos pensamentos, vontades e ordens eclesiásticas, e as práticas terapêuticas também não fugiam a essa regra, é possível que o termo MÉDICI tenha dado origem ao nome MEDICINA por influência dos clérigos que eram membros dessa família.